Свидетель рассказал, что незадолго до убийства Политковская приезжала в Лондон, где встречалась с Березовским. По его словам, бизнесмен просил журналистку опубликовать несколько расследований, но та отказалась из-за «недостаточности доказательств». По данным источника, Березовский был раздражен и своей «досадой» делился с окружением. Источник «Росбалта» полагает, что «эти люди могли быть заказчиками» убийства.

Политковскую застрелили в лифте ее собственного дома в октябре 2006 года. Убийство журналистки связывают с ее материалами о Чечне. В мае 2015 года по делу об убийстве признали виновными уроженца Чечни Лом-Али Гайтукаева (организатор), его племянников Рустама (исполнитель), Джабраила и Ибрагима Махмудовых (следили за журналисткой) и бывшего полицейского Сергея Хаджикурбанова (помогал убийцам).

Заказчика убийства до сих пор не установили. В конце 2015 года дети журналистки Илья и Вера Политковская подали жалобу в ЕСПЧ на неэффективное расследование дела в России. Версия о причастности Березовского появилась с начала расследования, но, по словам Ильи Политковского, оказалась «несостоятельной».

В сентябре 2011 года официальный представитель Следственного комитета Владимир Маркин опубликовал книгу «Самые громкие преступления XXI века в России». В ней он писал о возможной причастности Березовского к убийству.«Новая газета» заявляла, что «скандал вокруг демонической фигуры Бориса Березовского можно расценивать не иначе, как политическую провокацию». Информацию о том, что следствие рассматривает бизнесмена как кандидата на заказчика убийства, издание называло «несоответствующей действительности».

В октябре 2016 года Хаджикурбанов рассказал, что его и других осужденных по делу просят дать показания против Бориса Березовского и назвать его заказчиком убийства. Кто именно об этом просил, адвокат Хаджикурбанова уточнить не смог: «Неизвестные не представились и не показали удостоверений».